Во многих лабораториях мира, особенно для диагностики новорожденных, в методе DBS до сих пор используется способ «вырубки» пятен. Для этого, сухое пятно с карточки DBS «вырубают» и извлекают в центрифужные микропробирки. Сразу после «вырубки» диска теряется связь между пробой и этикеткой. Кроме того, диски требуют аккуратного обращения.
Процесс экстрагирования DBS отличается в зависимости от используемого растворителя, времени и способа. После проведения центрифугирования, экстракты либо непосредственно анализируются, либо высушиваются и растворяются в подвижной фазе. «Вырубка» пятен крови и экстракция в ручном режиме трудоемкий и долговременный процесс, поэтому не предназначена для анализа большого количества образцов. При ручном экстрагировании используется большое количество расходных материалов.

Процедура экстракции DBS вручную
Ручной процесс экстрагирования DBS включает несколько этапов: сначала все виалы маркируются в соответствии с данными образца, эта же информация вводится в список образцов для анализа в ВЭЖХ-МС. Затем диски «вырубают» и их переносят в виалы. Ручной процесс экстракции 1 образца занимает от 30 минут до 4 часов (4 часа; например, при анализе маркера алкоголя PEth). Затем надосадочную жидкость переносят в виалу для ВЭЖХ и загружают в автосамплер. Ручной процесс DBS требует использование множества вспомогательных инструментов — дозаторов, шейкеров, центрифуг и испарителей.

Пример карточки DBS после экстрагирования с помощью CAMAG DBS-MS 500 (пятна 1-3, 6 мм головка) и после «вырубки» (пятно 4). При автоматизации связь информации с карточки и извлеченного пятна неразрывна; штрих-код карточки и детекции делают перепутывание образцов невозможнымм. При автоматизации карточка DBS всегда экстрагируется из центра пятна крови.